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从我国水产品质量安全问题的发展过程来看，随着水产养殖规模的扩大、集约化程度的提高，养殖者、养殖环境、养殖方式、良种选育、病害防治、养殖药品、饲料生产等方面存在的许多矛盾和问题逐渐暴露出来，影响水产品质量安全从水产品质量安全管理要素分析，水产品质量安全事件的主要制约因素表现为：
1、生产者认识不足
我国渔业从业人员的受教育水平普遍较低，质量观念仅停留在水产品的外观上。如是否鲜活、色泽如何等，而有关渔用药物和水产养殖病害等方面的知识相对不足。在生产经营中一是为降低养殖成本，使用添加激素的底成本饲料或相对质量差的饲料。二是遇到病虫灾害时，在缺乏科学指导的情况下，往往是病急乱投医，不严格按照有关规定使用药物。三是养殖场、户生产、用药、销售记录尚未建立健全。这些都给水产品的质量安全埋下了隐患。
2、渔业设施的落后
基本渔业设施建设滞后，特别是养殖池塘，由于开发的时间较长，池中淤泥、鱼虾的排泄物、残饵及动物尸体、植物碎屑等沉积于池底，形成污染，呈老化状态，生产条件很难达到健康养殖的需求。这些有机物到了翌年的养成期时，会因为水温高而大量分解，消耗水中的溶氧，产生各种有毒物质，带来病害隐患。
4、养殖环境恶化
水是养殖生产的核心物质要素，是养殖业发展的命脉。然而随着工业发展及人口的增加，大量的工业废水、城市生活污水、农业用药（有机氯、有机磷农药，菊脂类农药等）、化肥（氮、磷肥）等排入江河、湖泊、水库水域，造成渔业养殖环境恶化。
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